氨基寡糖素可以抑制植物病原菌孢子的萌发和生长,对其具有阻碍的作用,可以有效地防治病原菌感染,减少病虫害的侵染。氨基寡糖素与常规防病药剂组合减量处理对作物病害具有防治作用,例如防治棉花枯黄萎病、甜瓜白粉病、甜瓜疫霉病、西瓜枯萎病、葡萄霜霉病等。
氨基寡糖素处理可以促进减轻施用农药引起的药害,诱导植物分泌抗性酶,促进植物细胞的活化,刺激植物性生长,并增强对病虫害的自我保护能力,例如缓解由2,4-D丁酯引起的药害。壳寡糖可以使植物细胞壁变厚或是木质化程度增强,诱导一系列防御反应,提高植物抗病能力和抵御不良环境条件的能力。